人類胃腸道樣本采集
糞便
a.成年人糞便
1)在收集糞便樣本前將尿液排盡，避免尿液污染糞便。將無(wú)菌糞便收集盒（或其他無(wú)菌收集器）放入蹲式（或坐式）馬桶后排便，確保糞便排入盒中。
2)將手洗干凈或戴上無(wú)菌手套，擰開(kāi)2mL無(wú)菌凍存管蓋，將滅菌拭子的棉頭插入糞便中，并輕微攪動(dòng)。
※注意：因糞便表層含有腸粘膜脫落細(xì)胞，而外部容易污染，且接觸空氣后，部分細(xì)菌DNA開(kāi)始降解，所以取樣時(shí)應(yīng)取中段內(nèi)部的糞便樣本。
3)用拭子取黃豆大?。s50mg）樣本放入螺口凍存管，取出棉簽，旋緊凍存管蓋。一式三管，一管用于測(cè)序?qū)嶒?yàn)，另外兩管備份。
4)將凍存管放入自封袋中，并封緊，馬上放入裝有碎冰或冰袋的保溫盒中，在短時(shí)間（最長(zhǎng)不超過(guò)4h）送至實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行DNA抽提或-80℃保存，防止反復(fù)凍融。
b.嬰兒糞便
1)在收集糞便樣本前將尿液排盡，避免尿液污染糞便。
2)帶一次性無(wú)菌手套，將新鮮糞便收集到無(wú)菌糞盒里，或采用潤(rùn)滑的無(wú)菌醫(yī)用拭子對(duì)會(huì)陰部刺激促進(jìn)排便。然后用無(wú)菌拭子挑取糞便至無(wú)菌螺口凍存管，一式三管，每管約50-100mg，一管用于測(cè)序?qū)嶒?yàn)，另外兩管備份。
3)將凍存管放入自封袋中，并封緊，馬上放入裝有碎冰或冰袋的保溫盒中，在短時(shí)間（最長(zhǎng)不超過(guò)4h）送至實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行DNA抽提或-80℃保存。防止反復(fù)凍融。
肛拭子/直腸拭子
1)不易獲得糞便時(shí)，可采用直腸拭子法進(jìn)行腸道微生物樣本的采集。
2)使用肥皂、水和70%的酒精分別清潔肛門周圍，然后將無(wú)菌拭子用生理鹽水濕潤(rùn)后插入肛門4~5cm（幼兒2~3cm）肛門括約肌處輕柔的旋轉(zhuǎn)，于肛門隱窩處取樣（拭子上明顯可見(jiàn)糞便痕跡），每個(gè)樣本提供3-5個(gè)拭子。
3)然后插入無(wú)菌凍存管（或?qū)⒚奘米宇^部剪落入凍存管中），旋緊蓋子，馬上放入裝有碎冰或冰袋的保溫盒中。
4)在短時(shí)間（最長(zhǎng)不超過(guò)4h）送至實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行DNA抽提或-80℃保存。
腸道灌洗液
1)將腸道灌洗液低速離心（800-1000g離心5min）收集上清液，將上清液過(guò)0.22μm可拆卸的濾膜，收集濾膜；放入-80℃冰箱保存。
2)或者將腸道灌洗液先低速離心（800-1000g離心5min）收集上清液，然后將上清液12,000g離心10min，棄上清保留沉淀，然后將沉淀管裝入自封袋密封，放-80℃冰箱保存。
人類泌尿生殖道樣本采集
宮腔分泌物/陰道分泌物（拭子）
1)48h內(nèi)無(wú)性行為，不得進(jìn)行私處清洗、上藥等改變菌群結(jié)構(gòu)的行為，30d內(nèi)不能用抗生素和抗真菌類藥物。
2)將采樣拭子伸入需要取樣部位，按壓深度約為拭子直徑，來(lái)回滾動(dòng)擦拭四次，以覆蓋整個(gè)拭子，然后取出。采集2~3根拭子。
3)將拭子插入無(wú)菌凍存管（或?qū)⑹米宇^部剪落入凍存管中），旋緊蓋子，馬上放入裝有碎冰或冰袋的保溫盒中，在短時(shí)間（最長(zhǎng)不超過(guò)4h）送至實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行DNA抽提或-80℃保存。
尿液
1)采集尿液之前用中性肥皂水或者清水對(duì)尿道口周圍進(jìn)行清潔。
2)集受試者晨尿的中段尿液50mL左右（中段尿：在排尿過(guò)程中，棄去前、后時(shí)段排出的尿液，以無(wú)菌容器收集中間時(shí)段的尿液；或在開(kāi)始排尿3s后采集尿液，當(dāng)尿液量達(dá)到50mL，即認(rèn)為完成收集）。
3)將尿液樣本馬上放入裝有碎冰或冰袋的保溫盒中，在短時(shí)間（最長(zhǎng)不超過(guò)4h）送至實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行菌體富集。尿液在4℃，1000g離心5min；取上清繼續(xù)10,000g離心5min富集菌體（需達(dá)到0.2-0.3g）。將沉淀立即置于-80℃保存。
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